San Andres liegt nordwestlich des kolumbianischen Festlandes vor der Küste Nicaraguas. Eine Hügelkette zieht sich durch die ganze Insel. Auf dem höchsten Punkt (80m ü.M.) befindet sich die älteste Baptistenkirche Amerikas, welche 1847 erbaut wurde. Auf San Andres gibt es nur wenige - dafür aber sehr schöne - Sandstrände. Der Rest der Insel besteht aus zerklüfteten Vulkangestein. Um die ganze Insel herum führt eine Hauptstraße, von der immer wieder einzelne Nebenstraßen ins Innere führen.